Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PgrQ00175 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PgrQ00175 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PgrQ00175 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PgrQ00175 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PgrQ00175 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PgrQ00175 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PgrQ00175 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms