Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx2P81066 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx2P81066 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx2P81066 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx2P81066 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx2P81066 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx2P81066 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx2P81066 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx2P81066 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx2P81066 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms