Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SeboxP70368 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SeboxP70368 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SeboxP70368 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SeboxP70368 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms