Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aup1P70295 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aup1P70295 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aup1P70295 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aup1P70295 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aup1P70295 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aup1P70295 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms