Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpdl3aP70158 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpdl3aP70158 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3aP70158 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms