Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcbP68404 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcbP68404 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms