Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp3P63024 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp3P63024 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms