Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp46P62069 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp46P62069 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp46P62069 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp46P62069 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp46P62069 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp46P62069 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp46P62069 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms