Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrch1P62046 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrch1P62046 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrch1P62046 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms