Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fgf1P61148 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgf1P61148 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms