Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm2P58774 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tpm2P58774 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm2P58774 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms