Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtskP55097 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtskP55097 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtskP55097 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtskP55097 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtskP55097 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtskP55097 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtskP55097 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CtskP55097 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtskP55097 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtskP55097 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtskP55097 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtskP55097 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtskP55097 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtskP55097 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtskP55097 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtskP55097 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtskP55097 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtskP55097 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtskP55097 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtskP55097 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtskP55097 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtskP55097 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtskP55097 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CtskP55097 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtskP55097 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtskP55097 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtskP55097 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtskP55097 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtskP55097 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtskP55097 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtskP55097 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtskP55097 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms