Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolgP54099 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolgP54099 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolgP54099 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolgP54099 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolgP54099 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolgP54099 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PolgP54099 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolgP54099 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolgP54099 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolgP54099 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolgP54099 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolgP54099 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolgP54099 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolgP54099 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolgP54099 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolgP54099 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolgP54099 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolgP54099 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolgP54099 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolgP54099 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolgP54099 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PolgP54099 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolgP54099 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PolgP54099 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolgP54099 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolgP54099 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolgP54099 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolgP54099 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolgP54099 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolgP54099 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolgP54099 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolgP54099 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolgP54099 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolgP54099 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolgP54099 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PolgP54099 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PolgP54099 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PolgP54099 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolgP54099 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolgP54099 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolgP54099 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolgP54099 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolgP54099 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolgP54099 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolgP54099 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolgP54099 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolgP54099 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolgP54099 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolgP54099 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolgP54099 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms