Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpbP50405 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SftpbP50405 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpbP50405 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SftpbP50405 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpbP50405 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SftpbP50405 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpbP50405 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms