Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PcntP48725 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PcntP48725 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcntP48725 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcntP48725 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PcntP48725 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PcntP48725 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PcntP48725 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcntP48725 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcntP48725 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcntP48725 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcntP48725 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcntP48725 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcntP48725 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PcntP48725 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcntP48725 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcntP48725 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcntP48725 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcntP48725 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcntP48725 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcntP48725 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PcntP48725 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcntP48725 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcntP48725 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcntP48725 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcntP48725 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcntP48725 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcntP48725 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcntP48725 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcntP48725 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PcntP48725 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PcntP48725 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcntP48725 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcntP48725 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcntP48725 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcntP48725 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcntP48725 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcntP48725 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PcntP48725 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PcntP48725 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcntP48725 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcntP48725 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcntP48725 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcntP48725 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcntP48725 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PcntP48725 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PcntP48725 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PcntP48725 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PcntP48725 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcntP48725 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcntP48725 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcntP48725 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcntP48725 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcntP48725 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcntP48725 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcntP48725 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcntP48725 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcntP48725 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PcntP48725 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms