Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnfsf4P43488 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf4P43488 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms