Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3aP28741 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kif3aP28741 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kif3aP28741 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms