Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxrgP28705 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrgP28705 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrgP28705 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrgP28705 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrgP28705 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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