Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrbP28704 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrbP28704 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrbP28704 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrbP28704 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrbP28704 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrbP28704 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxrbP28704 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxrbP28704 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RxrbP28704 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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