Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcb1aP21447 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcb1aP21447 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcb1aP21447 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms