Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ntf3P20181 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ntf3P20181 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ntf3P20181 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ntf3P20181 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ntf3P20181 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntf3P20181 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntf3P20181 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms