Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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