Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P18530 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P18530 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P18530 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P18530 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P18530 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P18530 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P18530 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P18530 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P18530 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P18530 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P18530 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P18530 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P18530 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P18530 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P18530 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P18530 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P18530 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P18530 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P18530 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P18530 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P18530 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P18530 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P18530 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P18530 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P18530 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P18530 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P18530 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P18530 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P18530 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P18530 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P18530 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P18530 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P18530 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P18530 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P18530 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P18530 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P18530 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P18530 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P18530 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P18530 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P18530 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P18530 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P18530 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P18530 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P18530 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P18530 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P18530 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms