Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd44P15379 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd44P15379 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd44P15379 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd44P15379 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd44P15379 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd44P15379 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd44P15379 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms