Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccl4P14097 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl4P14097 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms