Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scd1P13516 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scd1P13516 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scd1P13516 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scd1P13516 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scd1P13516 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scd1P13516 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scd1P13516 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scd1P13516 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scd1P13516 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scd1P13516 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scd1P13516 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms