Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl1P12850 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl1P12850 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl1P12850 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl1P12850 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl1P12850 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl1P12850 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl1P12850 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl1P12850 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms