Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa9P09631 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa9P09631 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa9P09631 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa9P09631 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms