Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NefmP08553 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NefmP08553 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NefmP08553 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NefmP08553 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NefmP08553 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NefmP08553 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NefmP08553 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NefmP08553 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NefmP08553 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NefmP08553 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NefmP08553 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NefmP08553 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NefmP08553 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NefmP08553 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NefmP08553 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NefmP08553 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NefmP08553 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NefmP08553 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NefmP08553 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NefmP08553 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NefmP08553 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NefmP08553 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NefmP08553 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NefmP08553 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NefmP08553 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefmP08553 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NefmP08553 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NefmP08553 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NefmP08553 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NefmP08553 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NefmP08553 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NefmP08553 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NefmP08553 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NefmP08553 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NefmP08553 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NefmP08553 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NefmP08553 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NefmP08553 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NefmP08553 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NefmP08553 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NefmP08553 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NefmP08553 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NefmP08553 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NefmP08553 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NefmP08553 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NefmP08553 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NefmP08553 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NefmP08553 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NefmP08553 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NefmP08553 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NefmP08553 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NefmP08553 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefmP08553 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefmP08553 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefmP08553 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefmP08553 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefmP08553 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefmP08553 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NefmP08553 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NefmP08553 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NefmP08553 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NefmP08553 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NefmP08553 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NefmP08553 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NefmP08553 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NefmP08553 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NefmP08553 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NefmP08553 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NefmP08553 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NefmP08553 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NefmP08553 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms