Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06328 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P06328 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P06328 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06328 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P06328 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06328 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06328 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06328 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06328 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06328 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06328 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06328 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06328 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06328 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06328 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06328 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06328 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06328 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06328 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06328 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06328 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06328 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06328 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06328 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms