Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp8O89110 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp8O89110 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp8O89110 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp8O89110 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp8O89110 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp8O89110 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp8O89110 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp8O89110 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp8O89110 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms