Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccl20O89093 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ccl20O89093 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl20O89093 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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