Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp1O89090 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp1O89090 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp1O89090 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp1O89090 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp1O89090 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp1O89090 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp1O89090 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp1O89090 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp1O89090 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms