Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc6a20bO88575 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a20bO88575 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20bO88575 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20bO88575 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms