Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms