Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9aO70228 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp9aO70228 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp9aO70228 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp9aO70228 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms