Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Banf1O54962 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Banf1O54962 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Banf1O54962 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Banf1O54962 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Banf1O54962 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Banf1O54962 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Banf1O54962 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Banf1O54962 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms