Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf9O35739 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf9O35739 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf9O35739 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf9O35739 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf9O35739 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf9O35739 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms