Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stag2O35638 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag2O35638 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stag2O35638 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag2O35638 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stag2O35638 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms