Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xbp1O35426 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xbp1O35426 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xbp1O35426 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms