Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc16a8O35308 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc16a8O35308 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc16a8O35308 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms