Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MsmbO08540 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MsmbO08540 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MsmbO08540 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MsmbO08540 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MsmbO08540 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MsmbO08540 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms