Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcrg-C3L7N479 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcrg-C3L7N479 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tcrg-C3L7N479 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tcrg-C3L7N479 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tcrg-C3L7N479 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tcrg-C3L7N479 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tcrg-C3L7N479 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tcrg-C3L7N479 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-C3L7N479 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tcrg-C3L7N479 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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