Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms