Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XntrpcF8VQM8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XntrpcF8VQM8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms