Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl9F7BE40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl9F7BE40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arl9F7BE40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms