Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28038F7BCN9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm28038F7BCN9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm28038F7BCN9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm28038F7BCN9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm28038F7BCN9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm28038F7BCN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm28038F7BCN9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28038F7BCN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28038F7BCN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm28038F7BCN9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm28038F7BCN9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm28038F7BCN9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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