Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Crocc2F6XLV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Crocc2F6XLV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Crocc2F6XLV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms