Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syngap1F6SEU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syngap1F6SEU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syngap1F6SEU4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms