Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt4E9Q649 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt4E9Q649 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt4E9Q649 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt4E9Q649 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt4E9Q649 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt4E9Q649 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcnt4E9Q649 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt4E9Q649 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt4E9Q649 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcnt4E9Q649 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms